В России существует целый ряд налоговых вычетов. Налог можно вернуть за абсолютно разные сферы деятельности, от покупки жилья и инвестиций в ценные бумаги, до лечения зубов и обучения.
Главным критерием, при котором возврат 13% возможен, является наличие белой зарплаты, то есть зарплаты, с которой в бюджет Российской Федерации производятся отчисления. Эти отчисления называются налогом на доходы физических лиц, их то и может вернуть потенциальный выгодополучатель.
Естественно, любой налоговый вычет ограничен, не только суммами прописанными в законе к возврату по той или иной категории, но и суммой уплаченных гражданином за календарный год налогов. То есть максимальная сумма возврата, будет меньше или равна сумме уплаченных за год налогов.
Что касается вопроса, то наличие открытого у гражданина ИИС(индивидуальный инвестиционный счет), не может быть причиной мешающей получить вычет за покупку квартиры, так же как и покупка квартиры не может помешать получению вычета по ИИС. Вопрос только в суммах. И если у вас большая, белая зарплата, с которой вы платите такие же большие налоги, то ничего не мешает вам вернуть, да же одновременно, эти налоги, как за покупку квартиры, так и за пополнение ИИС.