Налог на доходы физических лиц (НДФЛ) согласно Налогового кодекса является федеральным. Но это не означает, что он поступает именно в федеральный бюджет. Налог "федеральный" потому, что он устанавливается на уровне федерации (а не региона или еще лучше - муниципалитета), является общим для всех в стране (которая, напомню "Российская Федерация").
Распределением налогов по бюджетам ведает не налоговый кодекс, а бюджетный. Согласно этому нормативному документу налог на доходы физических лиц зачисляется в бюджеты субъектов РФ и в местные бюджеты муниципальных образований.
Иными словами: НДФЛ полностью остается в том регионе (крае, областе, республике, городе федерального значения), в котором его уплатили. Мало того, его частью распоряжаются непосредственно местные власти (городские, районные, поселковые, деревенские). Федеральный бюджет уже много лет не получает ничего.
По общему правилу поступления этого налога деляться как 85 на 15. т.е. в бюджет региона уходит 85 % собранного налога, а на местном уровне остается 15 %. Но регион вполне может эти доходы перераспределить (и как правило, так и поступает).
Например, в Приморском крае такие дополнительные отчисления есть для каждого муниципального образования, причём они индивидуальны. Скажем, НДФЛ, собранный в городе Дальнегорске, почти весь в его бюджете и остается (краевой бюджет получает чуть больше 26 %), а вот налог, уплаченный предприятиями и предпринимателями Тернейского района, делится почти пополам (точнее в краевой бюджет - 41 %, в местный - 59 %).