Инкубация — это вполне естественный процесс развития многих животных, которые откладывают яйца. (птицы, земноводные, ящерицы и многие другие.)
Этот процесс длится от кладки яиц, икры или спор вплоть до появления потомства, протекающий при определённых условиях, которые у каждого вида будут индивидуальны.
В первую очередь, для ответа на поставленный вопрос, нужно знать, что именно мы хотим найти. Если это известная бактерия - проблем никаких (относительно конечно). А вот в случае с неизвестным видом бактерии придется действительно повозиться.
Начнем с известных бактерий.
- Культуральный метод. Красота, а не метод. Ведь получив чистую культуру можно работать дальше. Проблема метода в том, что далеко не все бактерии будут расти. Кому-то субстрат не нравится, кому-то условия. Кого-то можно выцепить, приложив усилия - это так называемые прихотливые бактерии.
- Биохимический метод опять же хорош, но не без трудностей. Во-первых чистая культура нужна.
- Серологические методы, основанные на взаимодействии антиген-антитело. Коммерческих наборов хватает, работать можно. К серологии относятся также методы ИФА.
- Метод фагового типирования. Лично не работала.
- Молекулярно-генети<wbr />ческие методы. Ее величество ПЦР во всех вариациях. Красота! Чистая культура не обязательна, быстрый результат. Но. Но тоже есть. Первое но - подборка подходящих праймеров, чтобы было специфично И не давало перекрестной реакции. Второе но - наличие неспецифики. Третье но - должно быть специально оборудованное помещение. Можно и других но вспомнить. Но метод шикарен.
- Полногеномное секвенирование. Геном получили, проанализировали. Сказка! Но. Долго. Дорого. Сложно.
А теперь берем бактерии, о которых ничего не знаем. И все, беда. Почему и прорыв массовый в определении новых видов бактерий - все повально бросились секвенировать все подряд. И стали выявляться формы, которые невозможно достать другими методами.
Микробиомы - это такие сообщества, группы микроорганизмов разных видов, родов, классов и т.д., которые обитают на теле каждого живого многоклеточного организма и составляющие совокупность определенных микробиологических параметров (форм и видов бактерий, простейших и пр.), ферментов, белков, углеводов, других веществ, на основе анализа которых можно идентифицировать и индивидуализировать определенную особь. Так как у каждого человека, если говорить только о людях, состав этих самых групп микроорганизмов настолько отличается, словно ДНК, что можно определить с точностью человека, который пребывал в определенном помещении, прикасался к определенным предметам в плоть до того, что можно определить, что ел этот человек, который прикасался к стакану или столовому прибору, дверной ручке.
Это направление еще в стадии разработки в современной криминалистике, но пишут, что уже есть серьезные подвижки и предпосылки для внедрения в обычную практику.
Нет предела эволюцие. Живым организмам свойственно приспосабливаться и как результат выживать в борьбе за существование. Антибиотики это временная победа над болезнетворными организмами. Пока сам организм не выработает стратегию борьбы с врагами из вне он остается уязвим. Что такое антибиотики это вещества, которые другие организмы вырабатывают с целью выживания. Просто человек научился их использовать в своих личных целях. Вот если бы человеческий организм научился сам вырабатывать необходимое вещество действующее на конкретного врага. А потом еще смог корректировать его под мутирующие формы бактерий. Тогда можно было бы говорить о полной победе над болезнетворными микроорганизмами. А пока мы наблюдаем гонку вооружений.
Чтобы увидеть бактерии, микробы под микроскопом на предметном стекле, их сначала, надо покрасить. Иначе видно не будет в обычный микроскоп. Датский учёный-микробиолог, Грам, предложил свой способ окраски. Сначала стекло красят синей краской, метиленовый синий, или фиолетовый. Потом краску смывают. Те микробы которые сохранили краску и стали видны под микроскопом, называют грам-положительными. Чтобы увидеть других микробов, красят стекло красной краской, а потом опять её смывают. Микробы не взявшие синий цвет, окрашиваются в красный, или розовый. Такие бактерии называют грам-отрицательными. Методика уместна для определения вида бактерий, имеющих одинаковую форму, но по разному окрашивающихся в данные цвета. К примеру: пневмококки, менингококки, гонококки при окраски стекла синим имеют общую форму, располагаются по парно, и такой вид называют диплококками. После промывки стекла и покраске красным, гонококки из всех диплококков приобретут розовый цвет. Будут являться грам-отрицательными. Про бактерии гонореи есть стихотворная фраза на счёт её окраски и грам-отрицательности<wbr />. "И, что усугубляет драму, она не красится по Граму".