Существительное ящичек, образованное с помощью уменьшительного суффикса -ек- от мотивирующего слова ящик, -- оба имеют окончание, но не выраженное звуками при устной речи или буквами на письме.
Они имеют окончание нулевое.
Ну посмотрите, как появляются выраженные окончания в косвенных падежах:
из ящичк/а, к ящичк/у, над ящичк/ом, в ящичк/е.
Родственных слов у существительного ящик маловато.
Есть, например, прилагательное ящичный (замок, станок, поддон). Ну и маленький ящичек.
Достаточно и этих, чтобы сказать, что оба слова имеют общую значимую часть, то бишь корень ящич-,
в котором наблюдается привычное чередование согласных к-ч.
За корнем пристроился суффикс -ек-.
И получился простой морфемный строй слова
ЯЩИЧ/ЕК/ -- корень/суффикс/окончание нулевое.
Вот и разобрались с составом слова, не откладывая даже маленького дела в долгий ящичек.